Ulaşım olarak en merkezi noktalardan bir tanesidir.
Deniz otobüsü ve vapur seferleri, her ekspresin durduğu Bostancı Tren İstasyonu ve Kadıköy-Kartal Metrosu, Bostancı İstasyonu bulunmaktadır.
1930'lardan beri bu mahalleyi İETT'nin "4" adlı ring hattı Kadıköy'e bağlar. Taksim ve Kadıköy dolmuşlarının kalkış noktasıdır. Aynı şekilde Mecidiyeköy/Taksim ve Ümraniye otobüsleri de buradan kalkmaktadır.
Üst Bostancı'dan
2 Bostancı-Üsküdar
129T Bostancı-Taksim
19D Bostancı-Ümraniye
202 Bostancı-Taksim
13AB Bostancı-Ataşehir-Altunizade
10 Bostancı-Ataşehir-Ümraniye Devlet Hastanesi
Alt Bostancı'dan
4 Bostancı-Kadıköy
10B Bostancı-Kadıköy
10S Bostancı-Kadıköy
17S Bostancı-Uğur Mumcu
112 Bostancı-Taksim
133T Bostancı-Tuzla
19SB Bostancı-Sultanbeyli
E-9 Bostancı-Sabiha Gökçen Havalimanı
MR2 Bostancı-Ayrılık Çeşmesi
Şehir Hatları
Bostancı-Adalar (Kadıköy-Kabataş)
(Kabataş-Kadıköy)Adalar-Bostancı
(Yaz tarifesinde her cumartesi) Mehtaplı Geceler seferi
Şehir içi
İDO Kadıköy
İDO Kabataş
İDO Kadıköy-Yenikapı-Bakırköy
İDO Maltepe
İDO Büyükada-Heybeliada-Burgazada-Kınalıada-Kabataş
İDO Avcılar
İDO Boğaz Hattı
Şehirler Arası
İDO Kartal-Yalova
İDO Yenikapı-Armutlu-Armutlu Tatil Köyü
İDO Yenikapı-Marmara-Avşa
İDO Çınarcık
İDO Esenköy-Kumla
İDO Bandırma